Родился 16 мая 1941 года в селе Пировское Красноярского края. В 11 лет переехал с родителями на станцию Тайга, где и окончил школу. Первые рассказы писать начал ещё в детстве. Тогда же увлёкся палеонтологией. Палеонтолог и писатель Иван Антонович Ефремов пригласил юного школьника в настоящую палеонтологическую экспедицию в западное Зауралье. Окончил Томский государственный университет. С 1959 по 1965 годы работал в Институте геологии и геофизики СО АН СССР (Новосибирск), с 1965 по 1971 годы в Сахалинском комплексном научно-исследовательском институте СО АН СССР (Южно-Сахалинск), c 1971 по 1983 годы в Западно-Сибирском книжном издательстве (Новосибирск). Объехал многие страны мира. С геологическими и палеонтологическими экспедициями работал на Урале, в Сибири, на Дальнем Востоке, Камчатке, Курильских островах. 

Первая публикация - стихотворение «Тёма Ветров» (1956), в прозе - рассказ «Остров Туманов» (1957). Автор детективных, научно-фантастических и приключенческих повестей и романов. Повести и романы: «Разворованное чудо», «Царь-Ужас», «Секретный дьяк», «Носорукий», «Кормчая книга», «Теория прогресса» прочно вошли в «золотой» фонд отечественной литературы. 

Член Союза писателей СССР с 1982 года, Союза писателей России с 1992 года, Союза журналистов России с 1974 года. Заслуженный работник культуры РФ (2007), лауреат многочисленных премий, в том числе премии «Рыцарь фантастики» (2004). Книги Геннадия Прашкевича переведены на многие языки и издавались во многих странах. 

Также является автором научно-популярных книг «Самые знаменитые ученые России» (2000), «На заре жизни: берега Ангариды» (2003), автором биографий выдающихся писателей - фантастов. Роман «Пятый сон Веры Павловны» (написанный в соавторстве с Александром Богданом) номинировался на Букеровскую премию (2002). Перевел, составил и издал на русском языке антологию современной болгарской поэзии «Поэзия меридиана роз» (1982); книгу стихов корейского поэта Ким Цын Сона «Пылающие листья» (в соавторстве с В. Горбенко); роман Бруно Травена «Корабль мертвых». С 2008 года Геннадий Мартович вел ежемесячный семинар молодых писателей в городе Новосибирске.